木村敦 准教授 / KIMURA, Atsushi

クロマチンの不思議・ゲノムの神秘

木村敦 准教授 /  KIMURA, Atsushi

研究分野・テーマ・内容

研究分野 ゲノム生物学・生殖生物学
研究テーマ 生殖系における遺伝子発現の仕組み

研究内容

高等生物においてゲノムの大部分は遺伝子ではない領域で、多くの場合このような領域は遺伝子の発現を調節する機能を持っています。遺伝子の発現は細胞分化の方向性(その細胞がたどる運命)を決めたり細胞の活動を行ううえで非常に重要であり、個体を構成するそれぞれの細胞が正しく遺伝子発現を成し遂げることが生物にとって不可欠な課題の1つと言えます。私たちの研究室では生殖器官で機能する遺伝子に着目して、その発現パターンがどのようにして正しく維持されているのかについて調べています。将来的には遺伝子発現調節以外のゲノム機能にも迫りたいと考えています。

メッセージ

この研究室では生殖と発生に関わるゲノム機能や遺伝子発現をテーマとして研究を進めています。研究の主体は学生なので、ひとりひとりの学生が自分のデータをいかに注意深く見るかがとても重要です。自分の研究を発展させるためのトレーニングを積むことで、世界に通用する人材になってほしいと考えています。科学研究に興味のある方の来訪をお待ちしています。

参考文献・論文・著書

  • Kurihara M., Shiraishi A., Satake H., and Kimura A.P. (2014) A conserved noncoding sequence can function as a spermatocyte-specific enhancer and a bidirectional promoter for a ubiquitously expressed gene and a testis-specific long noncoding RNA. J. Mol. Biol. 426: 3069-3093
  • Matsubara S., Kurihara M., and Kimura A.P. (2014) A long non-coding RNA transcribed from conserved non-coding sequences contributes to the mouse prolyl oligopeptidase gene activation. J. Biochem. 155(4): 243-256
  • Yoneda R., Takahashi T., Matsui H., Takano N., Hasebe Y., Ogiwara K., and Kimura A.P. (2013) Three testis-specific paralogous serine proteases play different roles in murine spermatogenesis and are involved in germ cell survival during meiosis. Biol. Reprod. 88(5): 118, 1-14
  • Matsubara S., Takahashi T., and Kimura A.P. (2010) Epigenetic patterns at the mouse prolyl oligopeptidase gene locus suggest the CpG island in the gene body to be a novel regulator for gene expression. Gene 465: 17-29

nameKIMURA Atsushi

Research subject

Specialized field

Genome Biology, Reproductive Biology

Key words

・Epigenetic gene regulation in mammalian reproduction and development
・Proteases in mammalian spermatogenesis
・Prolyl oligopeptidase

Research subject

The following projects are ongoing in this laboratory.

1) Regulatory mechanisms of gene expression in the ovary, testis, and placenta.

Strict gene regulation is very important for life. We investigate regulatory mechanisms of several mouse genes that are expressed at high levels in the ovary, testis, and placenta.

2) Functions of proteases during spermatogenesis.

Spermatogenesis is a complicated process and the molecular mechanism is not well understood. We investigate novel testis specific proteases.

message

references

  • Kurihara M., Shiraishi A., Satake H., and Kimura A.P. (2014) A conserved noncoding sequence can function as a spermatocyte-specific enhancer and a bidirectional promoter for a ubiquitously expressed gene and a testis-specific long noncoding RNA. J. Mol. Biol. 426: 3069-3093
  • Matsubara S., Kurihara M., and Kimura A.P. (2014) A long non-coding RNA transcribed from conserved non-coding sequences contributes to the mouse prolyl oligopeptidase gene activation. J. Biochem. 155(4): 243-256
  • Yoneda R., Takahashi T., Matsui H., Takano N., Hasebe Y., Ogiwara K., and Kimura A. P. (2013) Three testis-specific paralogous serine proteases play different roles in murine spermatogenesis and are involved in germ cell survival during meiosis. Biol. Reprod. 88(5): 118, 1-14
  • Matsubara S., Takahashi T., and Kimura A. P. (2010) Epigenetic patterns at the mouse prolyl oligopeptidase gene locus suggest the CpG island in the gene body to be a novel regulator for gene expression. Gene 465: 17-29.