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原著論文

過去7年間に当研究室から発表した主な研究論文（2008年から現在まで）

  1. Amaike, Y., Oishi, T., Uraguchi, K., Abramov, A.V., and Masuda, R. (2015) Geographical variation in skull morphology in the Hokkaido population of the red fox, Vulpes vulpes. Mammal Study (in press).
  2. Kohyama, T.I., Akiyama, T., Nishida, C., Takami, K., Onuma, M., Momose, K., and Masuda, R. (2015) Isolation and characterization of major histocompatibility complex class II B genes in cranes. Immunogenetics 67: 705-710 (DOI: 10.1007/s00251-015-0874-x).
  3. Omote, K., Nishida, C., Takenaka, T., Saito, K., Shimura, R., Fujimoto, S., Sato, T., and Masuda, R. (2015) Recent fragmentation of the endangered Blakiston’s fish owl (Bubo blakistoni) population on Hokkaido Island, northern Japan, revealed by mitochondrial DNA and microsatellite analyses. Zoological Letters 1: 16 (DOI: 10.1186/s40851-015-0014-3).
  4. Masuda, R., Losey, R.J., Bazaliiskii, V.I., and Badmaev, B. (2015) Ancient DNA analysis of marmot tooth remains from the Shamanka and Lokomotiv-Raisovet Cemeteries near Lake Baikal: species identification and genealogical characteristics. Quaternary International (in press). (DOI: 10.1016/j.quaint.2015.03.050)
  5. Masuda, R. and Sato, T. (2015) Mitochondrial DNA analysis of Jomon dogs from the Kamikuroiwa Rock Shelter site in Shikoku and the Higashimyo site in Kyushu, Japan. Anthropological Science 123: 95-98. (DOI: 10.1537/ase.150111)
  6. Kohyama, T.I., Omote, K., Nishida, C., Takenaka, T., Saito, K., Fujimoto, S., and Masuda, R. (2015) Spatial and temporal variation at major histocompatibility class IIB genes in the endangered Blakiston’s fish owl. Zoological Letters 1: 13. (DOI:10.1186/s40851-015-0013-4)
  7. Hirata, D., Doichev, V.D., Raichev, E.G., Palova, N.A., Nakev, J.L. Yordanov, Y.M., Kaneko, Y., and Masuda, R. (2015) Genetic variation of the East Balkan Swine (Sus scrofa) in Bulgaria, revealed by mitochondrial DNA and Y chromosomal DNA. Animal Genetics 46: 209-212. (DOI: 10.1111/age.12269)
  8. Nagai, T., Murakami, T., and Masuda, R. (2014) Effectiveness of noninvasive DNA analysis to reveal isolated-forest use by the sable Martes zibellina on eastern Hokkaido, Japan. Mammal Study 39: 99-104. (DOI: 10.3106/041.039.0205)
  9. Hirata, D., Abramov, A.V., Baryshnikov, G.F., and Masuda, R. (2014) Mitochondrial DNA haplogrouping of the brown bear, Ursus arctos (Carnivora: Ursidae) in Asia, based on a newly developed APLP analysis. Biological Journal of the Linnean Society 111: 627-635.
  10. Kamada, S., Murakami, T., and Masuda, R. (2013) Multiple origins of the Japanese marten Martes melampus introduced into Hokkaido Island, Japan, revealed by microsatellite analysis. Mammal Study 38: 261-267.
  11. Hirata, D., Mano T., Abramov, A.V., Baryshnikov, G.F., Kosintsev, P.A., Vorobiev, A.A., Raichev, E.G., Tsunoda H., Kaneko, Y., Murata, M., Fukui, D., and Masuda, R. (2013) Molecular phylogeography of the brown bear (Ursus arctos) in northeastern Asia based on analyses of complete mitochondrial DNA sequences. Molecular Biology and Evolution 30: 1644-1652.
  12. Omote, K., Nishida, C., Dick, M.H., and Masuda, R. (2013) Limited phylogenetic distribution of a long tandem-repeat cluster in the mitochondrial control region in Bubo (Aves, Strigidae) and cluster variation in Blakiston’s fish owl (Bubo blakistoni). Molecular Phylogenetics and Evolution 66: 889-897.
  13. Kamada, S., Moteki, S., Baba, M., Ochiai, K., and Masuda, R. (2012) Genetic distinctness and variation in the Tsushima Islands population of the Japanese marten, Martes melampus (Carnivora: Mustelidae), revealed by microsatellite analysis. Zoological Science 29: 827-833.
  14. Nagai, T., Murakami, T. and Masuda, R. (2012) Genetic variation and population structure of the sable Martes zibellina on eastern Hokkaido, Japan, revealed by microsatellite analysis. Mammal Study 37: 323-330.
  15. Nagai, T., Raichev, E.G., Tsunoda, H., Kaneko, Y., and Masuda, R. (2012) Preliminary study on microsatellite and mitochondrial DNA variation of the stone marten Martes foina in Bulgaria. Mammal Study 37: 353-358.
  16. Kobayashi, F., Fukui, D., Kojima, E., and Masuda, R. (2012) Population genetic structure of the Japanese large-footed bat (Myotis macrodactylus) along three rivers on Hokkaido Island, northern Japan. Mammal Study 37: 227-235.
  17. Masuda, R., Kurose, N., Watanabe, S., Abramov, A.V., Han, S.H., Lin, L.K., and Oshida, T. (2012) Molecular phylogeography of the Japanese weasel, Mustela itatsi (Carnivora: Mustelidae), endemic to the Japanese islands, revealed by mitochondrial DNA analysis. Biological Journal of the Linnean Society 107: 307-321.
  18. Inoue, T., Kaneko, Y., Yamazaki, K., Anezaki, T., Yachimori, S., Ochiai, K., Lin, L.K., Pei, K.J.C., Chen, Y.J., Chang, S.W., and Masuda, R. (2012) Genetic population structure of the masked palm civet Paguma larvata, (Carnivora: Viverridae) in Japan, revealed from analysis of newly identified compound microsatellites. Conservation Genetics 13: 1095-1107.
  19. Tsytsulina, K., Dick, M.H., Maeda, K., and Masuda, R. (2012) Systematics and phylogeography of the steppe whiskered bat Myotis aurascens Kuzyakin, 1935 (Chiroptera, Vespertilionidae). Russian Journal of Theriology 11: 1-20.
  20. Koizumi, I., Usio, N., Kawai, T., Azuma, N., and Masuda, R. (2012) Loss of genetic diversity means loss of geological information: the endangered Japanese crayfish exhibits remarkable historical footprints. PLoS ONE 7(3): e33986. doi:10.1371/journal.pone.0033986.
  21. Omote, K., Nishida, C., Takenaka, T., and Masuda, R. (2012) Temporal changes of genetic population structure and diversity in the endangered Blakiston's fish owl (Bubo blakistoni) on Hokkaido Island, Japan, revealed by microsatellite analysis. Zoological Science 29: 299-304.
  22. Tsubouchi, A., Fukui, D., Ueda, M., Tada, K., Toyoshima, S., Takami K., Tsujimoto, T., Uraguchi, K., Raichev, E., Kaneko, Y., Tsunoda, H., and Masuda, R. (2012) Comparative molecular phylogeny and evolution of sex chromosome DNA sequences in the family Canidae (Mammalia, Canivora). Zoological Science 29: 151-161.
  23. Tashima, S., Kaneko, Y., Anezaki, T., Baba, M., Yachimori, S., Abramov, A.V., Saveljev, A.P., and Masuda, R. (2011) Identification and molecular variations of CAN-SINEs from the ZFY gene final intron of the Eurasian badgers (genus Meles). Mammal Study 36: 41-48.
  24. Tashima, S., Kaneko, Y., Anezaki, T., Baba, M., Yachimori, S., Abramov, A.V., Saveljev, A.P., and Masuda, R. (2011) Phylogeographic sympatry and isolation of the Eurasian badgers (Meles, Mustelidae, Carnivora): implications for an alternative analysis using maternally as well as paternally inherited genes. Zoological Science 28: 293-303.
  25. Kazuta, H., Sato, T., Dodo, Y., Matsumura, H., Amano, T., Ishida, H., and Masuda, R. (2011) Genotype frequencies of the ABCC11 gene in 2000–3000–year-old human bones from the Epi-Jomon and Jomon sites in Hokkaido, Japan. Anthropological Science 119: 81-86.
  26. Oishi, T., Uraguchi, K., Takahashi, K., and Masuda, R. (2011) Population structures of the red fox (Vulpes vulpes) on the Hokkaido Island, Japan, revealed by microsatellite analysis. Journal of Heredity 102: 38-46.
  27. Tashima, S., Kaneko, Y., Anezaki, T., Baba, M., Yachimori, S., and Masuda, R. (2010) Genetic diversity within the Japanese badgers (Meles anakuma), as revealed by microsatellite analysis. Mammal Study 35: 221-226.
  28. Sato, T., Kazuta, H., Amano, T., Ono, H., Ishida, H., Kodera, H., Matsumura, H., Yoneda, M., Dodo, Y., and Masuda, R. (2010) Polymorphisms and allele frequencies of the ABO blood group gene among the Jomon, Epi-Jomon and Okhotsk people in Hokkaido, northern Japan, revealed by ancient DNA analysis. Journal of Human Genetics 55: 691-696.
  29. Oishi, T., Uraguchi, K., Abramov, A.V., and Masuda, R. (2010) Geographical variations of the skull in the red fox Vulpes vulpes on the Japanese islands: An exception of Bergmann’s rule. Zoological Science 27: 939-945.
  30. Oishi, T., Uraguchi, K., and Masuda, R. (2010) Non-invasive genetic identification of the red fox Vulpes vulpes in the Shiretoko National Park, eastern Hokkaido, Japan. Mammal Study 35: 201-207.
  31. Goda, N., Mano, T., Kosintsev, P., Vorobiev, A., and Masuda, R. (2010) Allelic diversity of the MHC class II DRB genes in brown bears (Ursus arctos) and a comparison of DRB sequences within the family Ursidae. Tissue Antigens 76: 404-410.
  32. Inoue, T., Murakami, T., Abramov, A.V., and Masuda, R. (2010) Mitochondrial DNA control region variations in the sable Martes zibellina of Hokkaido Island and the Eurasian Continent, compared with the Japanese marten M. melampus. Mammal Study 35: 145-155.
  33. Masuda, R., Lin, L.K., Pei, K.J.C., Chen, Y.J., Chang, S.W., Kaneko, Y., Yamazaki, K., Anezaki, T., Yachimori, S., and Oshida, T. (2010) Origins and founder effects on the Japanese masked palm civet Paguma larvata (Viverridae, Carnivora), revealed from a comparison with its molecular phylogeography in Taiwan. Zoological Science 27: 499-505.
  34. Shimatani, Y., Takeshita, T., Tatsuzawa, S., Ikeda, T., and Masuda, R. (2010) Sex determination and individual identification of American minks (Neovison vison) on Hokkaido, northern Japan, by fecal DNA analysis. Zoological Science 27: 243-247.
  35. Yamada, C. and Masuda, R. (2010) Molecular phylogeny and evolution of sex-chromosomal genes and SINE sequences in the family Mustelidae. Mammal Study 35: 17-30.
  36. Shimatani, Y., Fukue, Y., Kishimoto, R., and Masuda, R. (2010) Genetic variation and population structure of the feral American mink (Neovison vison) in Nagano, Japan, revealed by microsatellite analysis. Mammal Study 35: 1-7.
  37. Sato, T., Amano, T., Ono, H., Ishida, H., Kodera, H., Matsumura, H., Yoneda, M., and Masuda, R. (2009) Mitochondrial DNA haplogrouping of the Okhotsk people based on analysis of ancient DNA: an intermediate of gene flow from the continental Sakhalin people to the Ainu. Anthropological Science 117: 171-180.
  38. Goda, N., Mano, T., and Masuda, R. (2009) Genetic diversity of the MHC class-II DQA gene in brown bears (Ursus arctos) on Hokkaido, northern Japan. Zoological Science 26: 530-535.
  39. Sato, T., Amano, T., Ono, H., Ishida, H., Kodera, H., Matsumura, H., Yoneda, M., and Masuda, R. (2009) Allele frequencies of the ABCC11 gene for earwax phenotypes among ancient populations of Hokkaido, Japan. Journal of Human Genetics 54: 409-413.
  40. Shimatani, Y., Takeshita, T., Tatsuzawa, S., Ikeda, T., and Masuda, R. (2008) Genetic identification of mammalian carnivore species in the Kushiro Wetland, eastern Hokkaido, Japan, by analysis of fecal DNA. Zoological Science 25: 714-720.
  41. Nakagome, S., Pecon-Slattery, J., and Masuda, R. (2008) Unequal rates of Y chromosome gene divergence during speciation of the family Ursidae. Molecular Biology and Evolution 25: 1344-1356.
  42. Masuda, R., Kaneko, Y., Siriaroonrat, B., Subramaniam, V., and Hamachi, M. (2008) Genetic variations of the masked palm civet Paguma larvata inferred from mitochondrial cytochrome b sequences. Mammal Study 33: 19-24.
  43. Tamada, T., Siriaroonrat, B., Subramaniam, V., Hamachi, M., Lin, L.-K., Oshida, T. Rerkamnuaychoke, W., and Masuda R. (2008) Molecular diversity and phylogeography of the Asian leopard cat, Felis bengalensis, inferred from mitochondrial and Y-chromosomal DNA sequences. Zoological Science 25: 154-163.

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解説論文

過去5年間に当研究室から発表した主な研究論文（2008年から現在まで）

  1. 増田隆一 (2014) DNAから見たヒグマの進化と歴史．モーリー (Hokkaido Nature Magazine MALLY) 35: 8-11.
  2. 増田隆一，井上友，江村正一，高田靖司，金子弥生 (2011) ハクビシンの多様性科学. 哺乳類科学 51: 188-191.
  3. 増田隆一 (2011) 日本のハクビシンは台湾からやってきた〜遺伝子から探る起源と多様性. どうぶつと動物園 63: 26-29.
  4. 増田隆一，嶋谷ゆかり，大石琢也，合田直樹，田島沙羅，佐藤丈寛 (2009) 食肉目の遺伝子分析を目的としたサンプリング法，遺伝子分析技術，遺伝情報の解析法および研究事例．哺乳類科学 49: 283-302.
  5. 増田隆一，福江佑子，谷地森秀二，浦口宏二 (2009) タヌキとキツネの多様性科学. 哺乳類科学 49: 137-141.
  6. 増田隆一 (2009) ハクビシンはどこから来たか〜ハクビシンの遺伝的変異. どうぶつと動物園 61: 22-25.
  7. Masuda, R., Sato, T., Grönwall, O., and Kato, M. (2008) Bird and mammal specimens in the Swedish Museum of Natural History originating from Hokkaido University: Bergman’s collection and a specimen gifted from Professor Saburo Hatta. Bulletin of Botanic Garden Hokkaido University 8: 1-8.

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主な著書

  1. 増田隆一（2008）人類の誕生と進化,「地球と生命の進化学（沢田健・綿貫豊・西弘嗣・栃内新，馬渡峻輔　編著）」，pp. 229-247，北海道大学出版会．
  2. 天野哲也，増田隆一，間野勉　編著（2006）ヒグマ学入門, 北海道大学出版会．
  3. 増田隆一，阿部永　編著 (2005) 動物地理の自然史, 北海道大学出版会．

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学生による学会発表（2012～2015年度）

  1. 表渓太，西田千鶴子，M. Dick，増田隆一：シマフクロウの系統的位置およびミトコンドリアDNAコントロール領域における巨大な反復配列の進化．日本動物学会北海道支部第57回大会，2012年8月25日，北海道大学（札幌）.
  2. 平田大祐，間野勉，A. Abramov，G. Baryshnikov，P. Kosintsev，A. Vorobiev，E. Raichev，角田裕志，金子弥生，村田浩一，増田隆一：ミトコンドリアDNA 全塩基配列に基づくヒグマの系統解析．日本動物学会北海道支部第57回大会，2012年8月25日，北海道大学（札幌）．＜日本動物学会北海道支部 研究奨励賞＞
  3. 表渓太，西田千鶴子，竹中健，齋藤慶輔，志村良治，増田隆一：絶滅危惧種シマフクロウにおける遺伝的多様性および集団構造の変遷．日本鳥学会2012年度大会，2012年9月14-17日，東京大学（東京）．
  4. 平田大祐，間野勉，A. Abramov，G. Baryshnikov，P. Kosintsev，A. Vorobiev，E. Raichev，角田裕志，金子弥生，村田浩一，増田隆一：ミトコンドリアゲノムに基づくヒグマの系統進化とハプログループの解析．日本哺乳類学会2012年度大会，2012年9月21-23日，麻布大学（相模原市）．
  5. 大石琢也，浦口宏二，A.V. Abramov，増田隆一：“日本列島におけるキツネ頭骨形態の地理的変異：ベルクマンの規則の検討”，四国自然史科学研究センター設立10周年記念シンポジウム「四国の自然は，いま2012」，2012年12月16日，高知大学（高知市）．
  6. 天池庸介，村上貴弘，増田隆一：糞DNA解析を用いた函館山キタキツネVulpes vulpes schrenckiの個体数推定．日本生態学会第60回大会，2013年3月5-9日，静岡県コンベンションアーツセンター（グランシップ静岡）.
  7. 秋山拓哉，甲山哲生，西田千鶴子，大沼学，百瀬邦和，志村良治，増田隆一：マイクロサテライト解析によるタンチョウ北海道集団の遺伝的多様性．日本動物学会北海道支部第58回大会，2013年8月24日，北海道教育大学札幌校（札幌）．
  8. 平田大祐（北大・院理），A. Abramov，G. Baryshnikov，増田隆一：ユーラシア大陸広域におけるヒグマの系統地理学的研究．日本動物学会北海道支部第58回大会，2013年8月24日，北海道教育大学札幌校（札幌）．＜日本動物学会北海道支部 優秀発表賞＞
  9. 甲山哲生，表渓太，西田千鶴子，竹中健，増田隆一：次世代シーケンサーによるシマフクロウMHC のジェノタイピング．日本動物学会北海道支部第58回大会，2013年8月24日，北海道教育大学札幌校（札幌）．
  10. 天池庸介，村上貴弘，大石琢也，増田隆一：マイクロサテライトDNA マーカーを用いた函館山キタキツネの集団構造解析．日本動物学会北海道支部第58回大会，2013年8月24日，北海道教育大学札幌校（札幌）．
  11. 平田大祐，A. Abramov，G. Baryshnikov，増田隆一：ユーラシア産ヒグマのミトコンドリアDNAハプログループ分析法の開発および系統地理的解析．第29回日本霊長類学会・日本哺乳類学会2013年度合同大会，2013年9月８日，岡山理科大学（岡山）．
  12. 天池庸介，浦口宏二，増田隆一：キタキツネVulpes vulpes schrencki集団における頭骨形態の地理的変異．第29回日本霊長類学会・日本哺乳類学会2013年度合同大会，2013年9月8日，岡山理科大学（札幌）．
  13. 表渓太，西田千鶴子，竹中健，齋藤慶輔，志村良治，藤本智，佐藤孝雄，増田隆一：集団遺伝学的解析によるシマフクロウ個体群の歴史的変遷．日本鳥学会2013年度大会，2013年9月16日，名城大学天白キャンパス（名古屋）．
  14. 表渓太，西田千鶴子，竹中健，齋藤慶輔，志村良治，藤本智，佐藤孝雄，増田隆一：mtDNA分析によるシマフクロウの集団構造変遷の解明．日本動物学会第84回岡山大会，2013年9月26日，岡山大学（岡山）．
  15. 甲山哲生，表渓太，西田千鶴子，竹中健，増田隆一：パイロシーケンシング法を用いた絶滅危惧種シマフクロウの主要組織適合遺伝子複合体（MHC）の多様性解析．日本動物学会第84回岡山大会，2013年9月26日，岡山大学（岡山）．
  16. 甲山哲生，秋山拓哉，表渓太，西田千鶴子，竹中健，大沼学，百瀬邦和，増田隆一：シマフクロウとタンチョウにおける主要組織適合遺伝子複合体（MHC）の多様性評価．日本生態学会第61回広島大会，2014年3月17日，広島国際会議場（広島）．
  17. 秋山拓哉，甲山哲生，大沼学，百瀬邦和，増田隆一：タンチョウ剥製標本のミトコンドリアDNA解析．日本動物学会北海道支部第59回大会，2014年8月23日，函館国際水産・海洋総合研究センター（函館市）．
  18. 秋山拓哉，甲山哲生，西田千鶴子，大沼学，百瀬邦和，増田隆一：タンチョウにおけるミトコンドリアDNAの遺伝的多様性と重複．日本動物学会第85回仙台大会，2014年9月13日，東北大学（仙台市）．
  19. 甲山哲生，秋山拓哉，西田千鶴子，大沼学，百瀬邦和，増田隆一：ツル目におけるMHC class IIB遺伝子の多型と進化．日本動物学会第85回仙台大会，2014年9月13日，東北大学（仙台市）．
  20. 秋山拓哉，甲山哲生，大沼学，百瀬邦和，増田隆一：主要組織適合遺伝子複合体（MHC）におけるタンチョウ北海道集団の遺伝的多様性．日本動物学会北海道支部第60回大会，2015年8月22日，北海道大学（札幌）．

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